Pour constituer le réseau, les Etats membres proposent :
- des Sites d'Intérêt Communautaire (SIC), considérés comme représentatifs des habitats naturels et des espèces d'intérêt communautaire. Ces sites prendront la dénomination de Zones Spéciales de Conservation (ZSC) après désignation formelle par la Commission européenne et la France.
- des Zones de Protection Spéciale (ZPS) sont également intégrées au titre de la directive « Oiseaux » pour la préservation des oiseaux sauvages et migrateurs et de leurs habitats.
En conclusion, deux zonages différents mais complémentaires sont utilisés pour constituer ce réseau européen.